1．并不是所有外源細(xì)菌都可以在體內(nèi)定殖，Ducluzeau et al. (1970)在體內(nèi)培養(yǎng)的10種細(xì)菌，通過(guò)飼料飼喂給大鼠，有五種細(xì)菌在通過(guò)消化道后被消除，三種細(xì)菌在動(dòng)物糞便是逐漸消失，只有二種逐步穩(wěn)定下來(lái)。
主要是從母體和環(huán)境中的微生物，出生三個(gè)小時(shí)就出現(xiàn)80%以上的菌種，到出生12個(gè)小時(shí)，結(jié)腸后段內(nèi)容物的細(xì)菌數(shù)目就可以達(dá)到109CFU/g（109表示10的9次方，由于微信編輯器的限制，無(wú)法上角標(biāo)，下同）。在出生建立的菌群中，由于厭氧菌的作用和乳中成分(乳糖，乳脂及免疫球蛋白的作用)，使得厭氧菌逐步成為優(yōu)勢(shì)菌群。出生48小時(shí)，90%以上的菌種都是厭氧菌(Swords et al.,1993; Figure).
出生后第一周內(nèi)，菌群中乳酸桿菌，鏈球菌成為優(yōu)勢(shì)菌群，內(nèi)容物會(huì)保持107-109CFU/g的數(shù)量。這樣的菌群優(yōu)勢(shì)數(shù)量會(huì)一直在哺乳期保持 (Swords et al., 1993;Ewing and Cole, 1994).
第二階段：一周齡開始到整個(gè)哺乳期
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在哺乳的整個(gè)過(guò)程，由于有穩(wěn)定的母乳的攝入，腸道的菌群保持相對(duì)的穩(wěn)定(Drasar and Barrow,1985; Mathew et al., 1998).厭氧菌對(duì)需氧菌的排斥作用達(dá)到比較完全的程度。乳酸菌與鏈球菌由于適合母乳的底物，在菌群生態(tài)環(huán)境依然保持優(yōu)勢(shì)地位。
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第三階段：斷奶階段
斷奶由于食欲下降，適應(yīng)固體飼料的應(yīng)激及離開母豬的環(huán)境應(yīng)激，導(dǎo)致了腸道結(jié)構(gòu)的不正常。同時(shí)，腸道的菌群也開始極不穩(wěn)定。尤其是受采食減少的影響，細(xì)菌用于發(fā)酵的內(nèi)容物減少，導(dǎo)致細(xì)菌所需養(yǎng)份的缺乏，在斷奶后的第一周，菌群的結(jié)構(gòu)最不穩(wěn)定，細(xì)菌的活力大大的降低(Wallgren and Melin, 2001)。細(xì)菌的活力需要二到三周的時(shí)間來(lái)恢復(fù) (Jensen et al., 1998).
Swords等 (1993)認(rèn)為由于固體飼料是的能量物質(zhì)以碳水化合物主，相對(duì)母乳中能量以脂肪為主，這樣比較復(fù)雜的化合物組成成為菌群發(fā)生變化的關(guān)鍵因素。 一旦斷奶開始，菌群在數(shù)量與種類發(fā)生了重要的變化 (Mathew et al., 1996; Jensen,1998; Konstantinov et al., 2004a).