生物信息學(xué) （ppt）

孫悟空

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重要生物信息中心簡介(國外） EMBnet，歐洲分子生物信息網(wǎng)（1982，1998，荷蘭） http://www.embnet.org/ NCBI(GenBank),美國國家生物技術(shù)信息中心（1979，1988）http://www.ncbi.nlm..nih.gov/ NIG(DDBJ),日本國立遺傳學(xué)研究所（1984，1987）http://www.ddbj.nig.ac.jp/ EBI,歐洲分子生物學(xué)研究所（1994，德國海德堡）http://www.ebi.ac.uk/ NCGR,美國國家基因組資源中心 http://www.ncgr.org/ JIPID,日本國際蛋白質(zhì)信息數(shù)據(jù)庫，它是PIR庫的三個協(xié)作單位之一。 SIB，瑞士生物信息研究所http://www.isb-sib.ch/ BioBase,丹麥生物技術(shù)信息中心http://biobase.dk 重要生物信息中心簡介(國內(nèi)） CBI或PKUCBI，北京大學(xué)生物信息中心（1997） http://www.cbi.pku.edu.cu/ 其可以立即進(jìn)入EMBnet主頁和若干重要生物數(shù)據(jù)庫的鏡象點（70多種） BioSino, 中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物信息中心http://www.biosino.org/ 是中國自己開發(fā)的核酸序列公共數(shù)據(jù)庫。 AMMSnic，中國軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院情報研究所網(wǎng)絡(luò)信息中心http://www.bmi.ac.cn/bio/ 中國科學(xué)院遺傳研究所人類基因組中心http://hgc.igtp.ac.cn 中國科學(xué)院國家基因組中心（1992）http://www.ncgr.ac.cn 中國科學(xué)院微生物研究所http://www.im.ac.cn/ CMBI/BJMU,北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部生物信息網(wǎng)頁http://cmbi.bjmu.edu.cn 數(shù)據(jù)庫目錄： 從1994年開始，《核酸研究》雜志每年第一期是生物數(shù)據(jù)庫專集，1998、1999、2000年分別介紹了102、105、114個數(shù)據(jù)庫。2000年開始，可以通過下面網(wǎng)址，按字母或分類查找，并且立即鏈接到所需要的數(shù)據(jù)庫。http://www.nar.oupjournals.org/ Dbcat,法國生物信息中心INFBIOOGEN維護(hù)的，建于1994年的生物數(shù)據(jù)庫目錄。北京大學(xué)生物信息中心有其鏡象，2000年5月底列舉了513種數(shù)據(jù)庫。http://www.infobiogen.fr/services/adcat/ 數(shù)據(jù)庫類別： 數(shù)據(jù)庫目錄 綜合數(shù)據(jù)庫 DNA序列數(shù)據(jù)庫 RNA序列和核糖體數(shù)據(jù)庫 基因圖譜數(shù)據(jù)庫 人類基因組數(shù)據(jù)庫 其他物種基因組數(shù)據(jù)庫 基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫 基因突變、病理和免疫數(shù)據(jù)庫 蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫 比較基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫 代謝途徑和細(xì)胞調(diào)控數(shù)據(jù)庫 與農(nóng)林有關(guān)數(shù)據(jù)庫 醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫 其他數(shù)據(jù)庫 與家畜家禽有關(guān)的數(shù)據(jù)庫 ChickGBASE, 雞基因圖譜計劃，搜集全世界雞基因圖譜信息，包括標(biāo)記、圖譜、微衛(wèi)星、命名規(guī)則、文獻(xiàn)，以及與雞基因圖譜計劃有關(guān)的單位名單等。http://www.ri.bbsrc.ac.uk/chickmap/chickbase/manager.html Swinemap,豬基因圖譜計劃，包含染色體圖譜和標(biāo)記。http://sol.marc.usda.gov/genome/swine/swine.html/ PiGBASE,豬基因圖譜信息庫，設(shè)在英國Roslin研究所、美國農(nóng)業(yè)部家畜基因組計劃和美國衣阿華大學(xué)。http://www.ri.bbsrc.ac.uk/pigmap/arkpig/ SheepBase,新西蘭牧業(yè)研究所建立，包含已發(fā)表的綿羊基因位點數(shù)據(jù)庫。http://dirk.invermay.cri.nz/ HorseMap,馬基因圖譜數(shù)據(jù)庫。http://www.ri.bbsrc.zc.uk/horsemap/arkhorse/ Bovmap,法國?；驁D譜數(shù)據(jù)庫。 http://locus.jouy.inra.fr/cgi-bin/bovmap/intro.pl [ 本帖最后由 孫悟空 于 2007-7-11 16:32 編輯 ]