|
應(yīng)用 RT- PCR 檢測鴨肝炎病毒Ⅰ型感染
羅玉均 1,張桂紅 1,陳建紅 2,張濟培 2,潘全會 1,鐘植文 1,何逸民 1,孔留五 1
(1.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院,廣東 廣州 510642;2.佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,廣東 佛山 528231)
中圖分類號: S858.32 文獻標識碼: A 文章編號: 1005-8567(2007)03-0020-02
收稿日期: 2007- 03- 15
鴨肝炎病毒Ⅰ型(duck hepatitis virus Ⅰ,
DHVⅠ)感染是雛鴨的一種急性高度致死性傳染病,
主要侵害 4 周齡以內(nèi)的雛鴨,特別是 1 周齡以下
的雛鴨最易感染,死亡率較高,是危害養(yǎng)鴨業(yè)最為
嚴重的傳染病之一[1]。1945 年在美國首次發(fā)現(xiàn),我
國于 1963 年在上海首次報道了該病的臨床病例,
至今,全國各養(yǎng)鴨地區(qū)均有不同程度的發(fā)生和流
行。目前,已有多種檢測 DHVⅠ抗原的方法,如免疫
電鏡、Dot-ELISA 和病毒中和試驗等,這些方法在
DHVⅠ的診斷中各有優(yōu)勢。PCR 作為一種新的分子
生物學(xué)檢測技術(shù),具有靈敏度高、快速、特異、操作
簡單等優(yōu)點[2~4]。本實驗通過目前已發(fā)表的 DHVⅠ基
因組序列相對保守的區(qū)域設(shè)計引物,成功建立了
RT-PCR 方法檢測鴨肝炎病毒 1 型。
1 試驗材料
1.1 病料 無菌采集廣東省 2 個地區(qū)(南海、三
水)送檢的病死鴨肝臟病料各 1 份,置于 -20℃保
存?zhèn)溆谩?br />
1.2 參考毒株 鴨肝炎病毒 I 型,新城疫病毒
(NDV clone-30)和禽流感滅活病毒(AIV)(H
5
和
H
9
亞型)。
1.3 主要試劑 Trizol 試劑、EX-Taq DNA 聚合
酶、2.5 mmol/L dNTP、AMV 反轉(zhuǎn)錄酶、RNA 酶抑制
劑(Rnasin)、10.0 mmol/L dNTP、Marker2000 均
購自 TaKaRa 公司;其它試劑均為國產(chǎn)分析純。
1.4 引 物 參照 GenBank 中發(fā)表的 DHVⅠ全基
因序列,應(yīng)用生物學(xué)軟件 Primer5.0 設(shè)計擴增
DHVⅠ3D 基因序列的特異性引物,引物序列為 F:
5-ATgTACCACTgTggTCATT-3,R:5-TCTTCAgAATTCA
TCTC-3,擴增片段長度為 250 bp,由上海 Sangon
生物公司合成。
2 方法
2.1 病 料 樣 品 的 處 理 取 無 菌 采 集 的 病 料
0.2~2.0 g 于玻璃研磨器中,研磨并用 TEN 緩沖
液稀釋成 1:3 乳劑,置于 EP 管中,-20℃/ 室溫反
復(fù)凍融 3 次,每次融化時使其在室溫中緩慢融化,
以便細胞破裂使病毒釋放出來。融化后的溶液以
4 000 r/min 離心 10 min,取上清經(jīng)除菌濾器過
濾。濾液 -20℃保存?zhèn)溆谩?br />
2.2 核 酸 的 抽 提 按 TRIZOL Reagent 說明書
提取 AIV(H
5
和 H
9
)、NDV 、DHVⅠ總 RNA。
2.3 cDNA 的 合 成 取抽提的 RNA 樣品進行反
轉(zhuǎn)錄。采用 20μL 反轉(zhuǎn)錄體系,其中含 1μL(25
nmol/L) 下 游 引 物 、2μL 10.00 mmol/L dNTP、
4μL 5×RT-PCR 緩沖液、1μL (40 U/L)AMV 酶、
8μL RNA 模板、1μL RNase 抑制劑,最后用 DEPC
水補至 20μL。42℃水浴 1 h,合成 cDNA,置 -20℃
保存?zhèn)溆谩?br />
2.4 RT- PCR 擴增 以 DHV I cDNA 為模板進行
PCR 擴增。反應(yīng)體系為 25μL,其中 EX-Taq 酶預(yù)混
劑,25 nmol/L 的上、下游引物各 0.5μL,模板
2μL,加滅菌水補足體積至 25μL。旋渦震蕩,混勻
后置于 PCR 儀中擴增。擴增程序為:94℃ 3 min,1
個循環(huán);94℃ 1 min、49℃ 1 min、72℃ 1 min,30
個循環(huán);72℃延伸 5 min。產(chǎn)物通過電泳進行檢測。
2.5 特異性試驗 以 DHVⅠ、AIV (H
5
和 H
9
)、NDV
進行特異性檢驗。
2.6 敏感性試驗 將 DHVⅠ的 cDNA 用紫外分光光
度測其含量為 0.6μg /μL,然后進行 10 倍系列
稀釋,然后進行 RT-PCR 擴增,以檢測其敏感性。
2.7 臨床樣品的檢測 按上述方法對臨床病例
的組織樣品進行 RT-PCR 檢測。
3 結(jié)果與分析
3.1 特異性檢驗結(jié)果 見圖 1。以 DHVⅠ擴增出
與試驗設(shè)計相符的 250 bp 電泳條帶,而對照的
AIV(H
5
和 H
9
)、NDV 擴增結(jié)果為陰性。
3.2 敏感性擴增結(jié)果 見圖 2,該 RT-PCR 可以
檢測到 0.06 ng/μL DHVⅠ的核酸模板。圖 1 RT- PCR 特異性擴增結(jié)果
M: Mar ker DL2000; 1. DHVⅠ; 2. AI V; 3. NDV
圖 2 RT- PCR 敏感性擴增結(jié)果
M: Mar ker DL2000; 1: 0. 6 μg/ μL; 2: 0. 06 μg/ μL;
3: 6 ng/ μL; 4: 0. 6 ng/ μL; 5: 0. 06 ng/ μL; 6: 1 pg/ μL
3.3 臨床病料檢測結(jié)果 見圖 3。
圖 3 臨床病料檢測結(jié)果
M: Mar ker DL2000; 1: 陰性對照;
2: 南海 DHVⅠ病料; 3: 三水 DHVⅠ病料。
4 討論
成年鴨在自然條件下被 DHVⅠ感染后,可長期
帶毒和排毒而不出現(xiàn)臨床癥狀,但進入環(huán)境中的
DHVⅠ對 4 周齡內(nèi)的雛鴨卻有高致病性,從而導(dǎo)致
該病毒在鴨群中廣泛傳播[1]。因此,建立快速、敏感、
特異的診斷方法是有效預(yù)防和控制該病的關(guān)鍵措
施之一。目前,對 DHVⅠ的診斷主要依靠流行病學(xué)
資料、臨床癥狀、病理變化及病毒的分離和鑒定。雖
然目前實驗室 DHVⅠ檢測方法有病毒的分離、
ELISA 與中和試驗(VN)等,但這些方法用于檢測感
染 DHVⅠ的死亡鴨組織中的病原時存在不足,如檢
測所需時間長、敏感性較低等,臨床應(yīng)用受到一定
的限制。本實驗通過建立 RT-PCR 方法,快速檢測感
染 DHVⅠ的死亡鴨組織,而且檢測結(jié)果表明該方法
具有較高的特異性與敏感性。RT-PCR 為 DHVI 的臨
床診斷及流行病學(xué)調(diào)查提供了可行的方法。
參考文獻:
[1] SAIF YM,BARNES HJ,GLISSON JR,et al.Diseases of Poul-
try[M].11thed.Ames:Iowa State University Press,2003.
343-354.
[2] HANSEN WR,BROWN SE,NASHOLD SE,et al.Identification
of duck plague virus by polymerase chain reaction[J].
A vian Dis,1999,43:106-115.
[3] PRITCHARD LI,MORRISSY C,PHUC KV,et al.Development
of a polymerase chain reaction to detect Vietnamese
isolates of duck virus enteritis [J].Vet Microbiol,
1999,68: 149-156.
[4] LUND M,NORDENTOFT S,PEDERSEN K,et al.Detection of
Campylobacterspp.in chicken fecal samples by real-
time PCR[J].J Clin Microbiol ,2004,42(11):5125-532.
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
獸醫(yī)臨床
應(yīng)用 RT- PCR檢測鴨肝炎病毒 I 型感染—羅玉均, 等
21 · · |
版權(quán)聲明:本文內(nèi)容來源互聯(lián)網(wǎng),僅供畜牧人網(wǎng)友學(xué)習(xí),文章及圖片版權(quán)歸原作者所有,如果有侵犯到您的權(quán)利,請及時聯(lián)系我們刪除(010-82893169-805)。
|